Die Organisation des TTT-Programms gliedert sich in zwei zentrale Ebenen: 

• Die Programmsteuerung, die alle übergreifenden Steuerungs- und Unterstützungsfunktionen bündelt. In ist der genaue Scope erklärt.
• Die Projektebene, bestehend aus den fachlichen Solutions Vertrieb (O2C), Fahrplan (C2S) und Betrieb (S2O), die jeweils spezifische Geschäftsanforderungen und Capabilities umsetzen.

Das Programm TAP/TAF TSI umfasst damit folgende Organisationselemente:

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